科学家让每个人的电脑都能参与攻克疾病研究 [复制链接]

ultra517 · 发表于 2012-9-10 13:04:45

BOINC
伯克利开放式网络计算平台（Berkeley Open Infrastructure for Network Computing，简称BOINC）是目前主流的分布式计算平台之一，由加州大学伯克利分校的电脑学系发展出来的分布式计算系统。它本身设计成用于SETIhome项目，但逐渐在其他领域包括数学、医学、天文学、气象学等。BOINC现时旨在为各研究者提供汇集全球各地大量个人电脑的强大运算能力。直至2012年3月25日，BOINC活跃： 290,743 志愿者， 472,834 计算机。
24 小时平均： 6.300 PetaFLOPS.

运行原理安**OINC软件的个人电脑在闲置时会使用个人电脑的CPU进行运算。即使个人电脑正被使用，假如仍有空闲的CPU周期，BOINC也会用作计算。如果使用者的电脑装有支持NVIDIA CUDA或ATI Stream技术的图形处理器(GPU)，某些BOINC项目的计算速度将比单纯使用CPU的版本提高2至10倍（2）。
当参与者使用个人电脑参与BOINC项目时，BOINC会与项目的服务器通信，服务器会向个人电脑提供工作包（Workunit，简称为WU），然后个人电脑会对工作包作出运算。完成后BOINC会把结果上传至项目的服务器。
每个项目有它的服务器，它用作协调各参与电脑的工作，包括发送工作包、接收已处理的结果、核对大量的结果再作处理，成为研究人员需要的数据。由于个别的个人电脑可能会在运算过程出现错误，所以服务器一般会把同一工作包传送至多个参与者，并比较各个结果。
BOINC设有积分系统，积分间接反映参与者的贡献。因为在BOINC上可以运行的项目千差万别，比如项目A的工作包在某台电脑上需要3个小时完成，而项目B的工作包在该电脑上需要30个小时才能完成，显然用完成的工作包的数目来衡量工作量是不可行的；类似的，电脑性能也有差别，用CPU时间来衡量工作量更是不行的。积分系统只能通过一定的算法得到参与者实际完成的计算量。
BOINC 从版本 6.4.5 起，开始支持GPU运算，目前有GPUgrid.net、SETIhome、Milkywayhome、AQUAhome、Collatz Conjecture、DNETCHome等多个GPU 专案。

说白了就是下载一个数据包程序运行，再把数据包，返回总站上。

详细操作和下载请到中国分布式计算总站

项目
旧BOINC标志随着BOINC普及，越来越多研究都使用BOINC，以下是依功能分类的项目列表：（粗体显示**重要工程）
生物学、医学DockingHome — 研究更深入的蛋白质键结和反应的原子等级构造和细节，并借由其研究结果来研发药物以治疗人类疾病。
DrugDiscoveryHome — 研发药物以治疗人类疾病。
Malaria Control — 模拟疟疾的影响及控制。
Predictorhome — 预测蛋白质的结构，目前已停止运作。
Proteinshome — 推论DNA的次序，目前已停止运作。
GPUGRID.net — 研究分子生物动力学相关的研究，主要运行环境为支援CUDA的NVidia GPU。
Rosettahome — 研究蛋白质的折叠。
RALPHHome — RosettaHome的测试专案。
SIMAP(Similarity Matrix of Proteins) －一个蛋白质同源计算序列并可以对这些序列数据提供专业的检索工具的数据库。
TANPAKU—利用布朗动力学方法计算蛋白质的结构，目前已停止运作。
POEMHOME — 利用能量法来研究蛋白质的结构。
MindModelingHome — 研究人类脑部的认知科学。
SuperlinkTechnion — 帮助科学家研究人类基因及其异常所产生的疾病。
The Lattice Project — 美国马里兰大学的研究生物资讯学领域相关的分布式计算平台。
Virtual Prairie
CelsHome
RNA world —研究分析生物中RNA的分子结构。
DNAHome—研究有关生物中DNA的基因调控作用。

目前世界有许多能为人类造福的项目都因计算不足而搁浅，或者没有很快完成！因此，我呼吁大家利用CPU的闲置计算能力，帮忙做做计算，也是为人类做贡献！通过加入分布式计算，你就可以为这些项目出一份力，大家可以进入******中国分布式计算总站******下载客户端，然后选择自己感兴趣的项目，加入以后就是自动下载任务，自动计算，自动上传结果，并且计算的优先级是最小的，也就是说只有CPU空闲时才计算，如果你有任务，CPU会优先计算你的任务，因此电脑一点都不卡，还可以手动调节CPU的利用率

BOINC和Folding@home的成果都是公开的

中国大量生物、医药类研究引用了Folding@home的研究成果
如：

《药物发现网格设计与实现》
张文举（1）陈曙东（1）刘了（3）马范援（1）沈建华（2）
（1）上海交通大学计算机系,上海200030 （2）中科院上海药物研究所,上海201203 （3）江南计算技术研究所,无锡214083

《一种分布式网格计算框架以及在大规模分子动力学模拟中的应用》
王文睿（1）陈国良（1）邢利荣（2）陈华平（1）孙广中（1）单久龙（1）
（1）中国科学技术大学国家高性能计算中心,安徽合肥230027 （2）上海电力学院数理系,上海201300

《GROMOS96分子动力学模拟的并行优化算法》
王文睿陈国良孙广中
中国科学技术大学计算机系国家高性能计算中心,合肥230027

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